154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1221 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  51.25 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  46.25 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  45 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  45.12 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.28 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  42.17 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  42.05 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  49.37 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.47 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  43.75 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  46.38 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  45 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  40.74 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  44 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  39.77 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  35.63 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.57 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  41.77 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.77 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.19 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.91 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  49.23 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  47.54 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  35.63 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  47.54 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  45.31 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  43.21 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  45.9 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.89 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  45 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.89 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  39.34 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  47.54 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  37.1 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  43.33 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  37.7 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.82 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.82 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  42.62 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  40.98 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.77 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  45 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.9 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  39.34 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.07 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.07 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  36.07 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.07 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  39.29 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  40.82 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  43.14 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  45.1 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.07 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.43 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.43 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  37.7 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  36.59 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  40 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  43.75 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  37.7 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  38.27 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  40.82 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  43.66 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  42.62 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  44.9 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1827  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000868037  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  40.82 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.71 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.59 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.92 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>