232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0734 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  94.81 
 
 		 135 aa  254  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  83.7 
 
 		 149 aa  234  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  80.6 
 
 		 135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  76.87 
 
 		 157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  78.36 
 
 		 135 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  77.61 
 
 		 135 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  77.61 
 
 		 135 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  76.12 
 
 		 135 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  77.61 
 
 		 135 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  76.12 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  76.12 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  76.12 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  76.12 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  76.12 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  76.12 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  76.12 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  74.63 
 
 		 135 aa  208  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  61.54 
 
 		 132 aa  166  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  60.77 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  60.77 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  60.16 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  52.07 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  51.56 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  51.64 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  53.23 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  48.87 
 
 		 133 aa  120  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.6 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  52.5 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  50.83 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  50.82 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.78 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.8 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  50.42 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  47.76 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.58 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  49.17 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.17 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  45.97 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.29 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  44.54 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.2 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  46.15 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  38.93 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  45.31 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02152  putative heat shock protein 15-like protein  43.7 
 
 		 176 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  40.94 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  48.54 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  40.65 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  41.46 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  40.83 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  48.06 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.06 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.03 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.67 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0265  RNA-binding S4  44.26 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  34.71 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  44.09 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1817  heat shock protein 15  46.03 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  44.88 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  44.26 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  45.3 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  44.63 
 
 		 130 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  39.2 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  52.5 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  36.22 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.28 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  39.23 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.93 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.32 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0365  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.2 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  35.77 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  36.64 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.69 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.07 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  38.69 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  32.23 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  38.24 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.79 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  38.1 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  37.6 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  37.1 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.54 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  36.07 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2926  heat shock protein 15  40.16 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  37.31 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0464  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.16 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  40.32 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.34 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.34 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  37.01 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.51 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  39.84 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.84 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  39.84 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  35.34 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.51 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.51 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>