218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2659 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  56.91 
 
 
128 aa  139  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.47 
 
 
132 aa  139  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  54.47 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.66 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.85 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  55.74 
 
 
136 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  55.83 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.89 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  56.56 
 
 
127 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  53.85 
 
 
138 aa  133  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4360  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.33 
 
 
132 aa  133  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  55.56 
 
 
134 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  51.2 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4736  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.24 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00728557  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.56 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  54.1 
 
 
136 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.56 
 
 
133 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.56 
 
 
133 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  54.1 
 
 
136 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  54.76 
 
 
133 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  54.47 
 
 
135 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  54.76 
 
 
133 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3621  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.67 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0308418  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  53.66 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.66 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  55.28 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.83 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.28 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.28 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.83 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0142  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.67 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.28 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.28 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.28 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  50.83 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.83 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  55.28 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  51.59 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.77 
 
 
138 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  51.26 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03252  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  54.47 
 
 
133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2926  heat shock protein 15  52.85 
 
 
133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03204  hypothetical protein  54.47 
 
 
133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  54.1 
 
 
137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.28 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  52.89 
 
 
125 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.5 
 
 
132 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  52.85 
 
 
128 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.76 
 
 
142 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.46 
 
 
135 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.89 
 
 
134 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  55.37 
 
 
131 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  50 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0365  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.55 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  53.72 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  52.89 
 
 
135 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  52.07 
 
 
135 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  52.1 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  44.17 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  51.59 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 
135 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  50 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  47.58 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  50.78 
 
 
133 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.78 
 
 
133 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.56 
 
 
133 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.2 
 
 
133 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0265  RNA-binding S4  50.41 
 
 
135 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  43.7 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  45.83 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.9 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  60 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  50.41 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  45.9 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  42.64 
 
 
167 aa  95.9  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1817  heat shock protein 15  52.5 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  44.63 
 
 
125 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  44.26 
 
 
132 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  43.65 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  49.12 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  43.44 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  43.55 
 
 
133 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  43.33 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.09 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02152  putative heat shock protein 15-like protein  42.86 
 
 
176 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  41.46 
 
 
135 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  42.5 
 
 
131 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001894  ribosome-associated heat shock protein  51.02 
 
 
100 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  41.46 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.65 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  43.33 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.46 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>