270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4145 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 134 aa  274  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  91.79 
 
 		 134 aa  256  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  57.25 
 
 		 133 aa  153  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  57.89 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.82 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  49.61 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  45.97 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  53.93 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  43.59 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  49.4 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.08 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5459  RNA-binding S4 domain protein  37.98 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507195  normal  0.0728213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.8 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1369  RNA-binding S4 domain protein  44.71 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6407  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.1 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0756783  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  38.81 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.96 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26490  heat shock protein Hsp15  39.06 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.352785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3706  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.58 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.325898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3883  RNA-binding S4 domain protein  39.66 
 
 		 293 aa  76.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1589  RNA-binding S4  39.23 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292038  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  38.97 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  38.97 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  38.97 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  38.97 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  38.97 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  38.97 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  38.97 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  37.82 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  33.07 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  39.06 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  39.67 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4803  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.38 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0850807  decreased coverage  0.0000637783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2738  RNA-binding S4 domain protein  42.59 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000217923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  39.02 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  36.92 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.3 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  43.53 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  41.18 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.81 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.11 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2423  putative heat shock protein 15 (HSP15)  41.3 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00936684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  37.5 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  36.36 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4856  RNA-binding S4 domain protein  40.96 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0730838  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4393  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.96 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.853125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  42.24 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  43.53 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  37.7 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  42.17 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1306  RNA-binding S4 domain protein  37.6 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.424308  decreased coverage  0.000297946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.92 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.88 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.92 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1827  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.57 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000868037  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  36.13 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  36.15 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  40.74 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  37.61 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.74 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.04 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3582  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.4 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.74 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3749  RNA-binding S4 domain protein  36.59 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.92 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  36.43 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0410  RNA-binding S4  40.45 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.553472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0505  RNA-binding S4  43.53 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0154787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2640  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.23 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0188  RNA-binding S4 domain protein  40.34 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  34.15 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  33.88 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  37.29 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  39.5 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.38 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2398  RNA-binding S4 domain protein  36.75 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136626  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12510  heat shock protein Hsp15  40.17 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0142  RNA-binding S4 domain protein  40.35 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.45 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  36 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  41.56 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  34.96 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.56 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  36.43 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19320  ribosome-associated heat shock protein implicated in recycling of 50S subunit  38.46 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0280  RNA-binding S4  45.98 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.16081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  35.34 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  37.4 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  39.74 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2740  RNA-binding S4  39.08 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.07 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  37.6 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.6 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7545  hypothetical protein  46.38 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  37.5 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  37.29 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  32.58 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>