230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3766 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5459  RNA-binding S4 domain protein  63.64 
 
 		 127 aa  159  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507195  normal  0.0728213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  66.38 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3883  RNA-binding S4 domain protein  64.96 
 
 		 293 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6407  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.78 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0756783  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  60.68 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26490  heat shock protein Hsp15  60 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.352785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1589  RNA-binding S4  58.68 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292038  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3749  RNA-binding S4 domain protein  58.12 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3582  RNA-binding S4 domain-containing protein  57.26 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1306  RNA-binding S4 domain protein  62.07 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.424308  decreased coverage  0.000297946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0188  RNA-binding S4 domain protein  59.48 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2738  RNA-binding S4 domain protein  62.26 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000217923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12510  heat shock protein Hsp15  56.78 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19320  ribosome-associated heat shock protein implicated in recycling of 50S subunit  64.96 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0142  RNA-binding S4 domain protein  59.43 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  60 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2398  RNA-binding S4 domain protein  58.47 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136626  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.41 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  52.34 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.34 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.34 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.65 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  40.16 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  53.27 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  40.5 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  37.82 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  39.23 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  39.34 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  40.16 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.6 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  39.67 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  43.44 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  40.5 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  41.6 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  37.39 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  40.98 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  40.8 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.98 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.84 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0265  RNA-binding S4  34.96 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  39.34 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  39.84 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  43.97 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  42.19 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  39.84 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  38.21 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  42.37 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.89 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  36.59 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  41.13 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  33.06 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  42.24 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  38.33 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.4 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  40.32 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  40.32 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.52 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  38.02 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  33.33 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.01 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  33.33 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  37.01 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0365  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  37.01 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2926  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.84 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.75 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.25 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00885  heat shock protein 15  34.48 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.467007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  38.84 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4736  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.79 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00728557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.84 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.75 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.09 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  29.75 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.26 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  39.5 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  39.5 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  37.4 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  38.02 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.25 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.02 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  37.9 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0142  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.15 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  35.88 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  28.93 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.93 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  29.51 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.93 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.93 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  34.21 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02152  putative heat shock protein 15-like protein  36.89 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.17 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.17 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>