211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3310 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  62.16 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  49.56 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2423  putative heat shock protein 15 (HSP15)  51.14 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00936684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.72 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  49.56 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  46.55 
 
 		 144 aa  95.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.14 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.14 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.65 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  50.59 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  40.65 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.62 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.5 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.65 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4856  RNA-binding S4 domain protein  53.95 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0730838  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.87 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.71 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3706  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.24 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.325898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4393  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.95 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.853125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  42.02 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  45.38 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.43 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  51.32 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  36.13 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  40.34 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  52.5 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  38.28 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  48.1 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4803  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.59 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0850807  decreased coverage  0.0000637783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  43.48 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  40.71 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.89 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  38.84 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  41.03 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1369  RNA-binding S4 domain protein  46.25 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2293  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.25 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0107303  normal  0.537391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.34 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.67 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0784  RNA-binding S4  54.55 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000665287  normal  0.0698441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.21 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  36.67 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2740  RNA-binding S4  38.75 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  47.44 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.52 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  39.29 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  35 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  38.79 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  43.04 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4117  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.84 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  36.67 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  36.13 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  38.66 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  43.9 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.67 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.13 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  38.98 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.83 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  38.66 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  36.13 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.83 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  40.83 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  37.72 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  34.15 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  34.75 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  37.82 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  34.15 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  35.59 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.59 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.82 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.75 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  38.74 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19320  ribosome-associated heat shock protein implicated in recycling of 50S subunit  38.94 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  41.77 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  36.44 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  36.44 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  36.44 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3582  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.05 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  36.44 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  36.44 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  36.44 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  36.44 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  36.44 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  37.82 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03252  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.83 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  41.18 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3749  RNA-binding S4 domain protein  38.94 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>