206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1642 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  100 
 
 		 147 aa  288  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  71.79 
 
 		 138 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2398  RNA-binding S4 domain protein  75.42 
 
 		 121 aa  149  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  66.09 
 
 		 117 aa  141  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3883  RNA-binding S4 domain protein  64.1 
 
 		 293 aa  140  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5459  RNA-binding S4 domain protein  61.21 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507195  normal  0.0728213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  62.81 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  65.71 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  65.71 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  65.71 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  67.83 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12510  heat shock protein Hsp15  59.17 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  60.68 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3749  RNA-binding S4 domain protein  52.46 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3582  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.1 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  67.26 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26490  heat shock protein Hsp15  60.68 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.352785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0142  RNA-binding S4 domain protein  59.43 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6407  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.65 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0756783  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2738  RNA-binding S4 domain protein  62.26 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000217923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1589  RNA-binding S4  54.03 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292038  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1306  RNA-binding S4 domain protein  56.9 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.424308  decreased coverage  0.000297946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19320  ribosome-associated heat shock protein implicated in recycling of 50S subunit  58.82 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0188  RNA-binding S4 domain protein  53.78 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  41.18 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  38.46 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  37.8 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  42.5 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  39.17 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  45 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.94 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  35.29 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.84 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  35.04 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.15 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  42.98 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  40.16 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  40.71 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  43.22 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  42.11 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  37.5 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  35.66 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  40.5 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  37.5 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.67 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.44 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.33 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  40.5 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  34.45 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  38.14 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.83 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  38.98 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  43.55 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  38.98 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  38.98 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  38.98 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  38.98 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  38.98 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  38.98 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00885  heat shock protein 15  34.17 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.467007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  40.62 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  34.85 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  37.29 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.29 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.67 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.69 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  37.1 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  32.54 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  38.66 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  35.83 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.44 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  31.4 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.13 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  37.6 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  35.54 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.3 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  37.7 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.59 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  31.5 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  35.43 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  36.51 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.04 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  37.19 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  36.13 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.65 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  37.1 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  29.41 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  35.83 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  30.66 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  32.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2926  heat shock protein 15  30.33 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.2 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  34.17 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  28.57 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>