226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2104 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  64.84 
 
 		 131 aa  174  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00885  heat shock protein 15  58.68 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.467007  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  46.61 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1589  RNA-binding S4  41.88 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292038  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  42.74 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0824  heat shock protein 15  45.16 
 
 		 94 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6407  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.82 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0756783  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26490  heat shock protein Hsp15  36.13 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.352785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  37.19 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.36 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3582  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.83 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3749  RNA-binding S4 domain protein  39.32 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.54 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  40 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3883  RNA-binding S4 domain protein  34.71 
 
 		 293 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.71 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  34.71 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.66 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  38.46 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  34.15 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  34.71 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  35.29 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  34.71 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5459  RNA-binding S4 domain protein  36.89 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507195  normal  0.0728213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  36.59 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.11 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12510  heat shock protein Hsp15  36.13 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.77 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  35.43 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.58 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0142  RNA-binding S4 domain protein  37.04 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  37.82 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  36.59 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  38.18 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.75 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  36.59 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  34.45 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  32.79 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  35 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19320  ribosome-associated heat shock protein implicated in recycling of 50S subunit  37.29 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  34.78 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0188  RNA-binding S4 domain protein  33.9 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  33.05 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.17 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.77 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1306  RNA-binding S4 domain protein  35.29 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.424308  decreased coverage  0.000297946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  36.13 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.65 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  32.81 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.29 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  32.23 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2398  RNA-binding S4 domain protein  36.75 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  36.97 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  30.77 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  33.33 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  40.74 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.74 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.74 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2738  RNA-binding S4 domain protein  37.61 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000217923  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  45 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  31.97 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02152  putative heat shock protein 15-like protein  31.93 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  31.67 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  36.07 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  31.9 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  35.54 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  33.88 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  32.77 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5939  putative heat shock protein  33.61 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  32.48 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  38.57 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  32.2 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  30 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0365  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.86 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  32.76 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  33.61 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.2 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  34.68 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.5 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.06 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  31.15 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  33.06 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.06 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  33.33 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.06 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  32 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3752  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.01 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  32.76 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  34.18 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>