59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0725 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.95 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  41.94 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.18 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.54 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  41.38 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  49.18 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  40.32 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  38.55 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  49.18 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  38.82 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  47.54 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  50.98 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  39.29 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  36.78 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.9 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  43.33 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  49.18 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  38.27 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  34.48 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  39.29 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  51.02 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  50.98 
 
 		 344 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  51.02 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.9 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  41.67 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  35.71 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  41.67 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.71 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.71 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  40.32 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2578  pseudouridine synthase, RluA family  46.15 
 
 		 343 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  41.94 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  47.27 
 
 		 311 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  47.27 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.99 
 
 		 137 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2903  RluA family pseudouridine synthase  42.11 
 
 		 323 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413037  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  38 
 
 		 297 aa  41.2  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  35 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  47.06 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  35.8 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>