163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0272 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  100 
 
 		 91 aa  177  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  67.09 
 
 		 93 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  64.56 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  59.49 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  60.76 
 
 		 89 aa  97.1  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  56.96 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  56.96 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  53.75 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.25 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  56.25 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.5 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.7 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  51.25 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  52.5 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  55 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  52.56 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  47.5 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  52.5 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  55.26 
 
 		 79 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.75 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.63 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.63 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  51.9 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  51.9 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  56.67 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  45.57 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  46.84 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  49.37 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.23 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  46.05 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.5 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  43.21 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  41.89 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  41.89 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  43.94 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  43.94 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  42.42 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.18 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.18 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  39.51 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  42.42 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  34.94 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  38.36 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  34.94 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  35 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  48 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  37.8 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  48 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  48 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  36.47 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.25 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  41.25 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  41.82 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  41.25 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  46 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  44 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  35 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  44 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.82 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  44 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  36.25 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  43.75 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  43.75 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  42 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  40.96 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  34.12 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.75 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  36.25 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  42 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  40.3 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  35.37 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  40.82 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  42 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  38.27 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  38.82 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  39.62 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.52 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.52 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  45.45 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.25 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>