115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0850 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  100 
 
 
81 aa  161  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  70.37 
 
 
81 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  69.14 
 
 
81 aa  120  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  69.14 
 
 
81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  64.2 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  62.82 
 
 
81 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  62.82 
 
 
81 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  61.54 
 
 
81 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  61.25 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  50.62 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  40.51 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.99 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  49.02 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  37.1 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  48.15 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  50.98 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  43.75 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  41.27 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  41.27 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  41.27 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  39.06 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  38.36 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.92 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  47.06 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  42.19 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  35.62 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  35.44 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.98 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.73 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  38.78 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.02 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  42.86 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  32.73 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.94 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  41.18 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  39.22 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.1 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.1 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  34 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  29.85 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  34.92 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.93 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  36 
 
 
128 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  29.85 
 
 
132 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  34.92 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2642  putative heat shock protein 15  29.85 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351064  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  40 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  34.25 
 
 
93 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0142  RNA-binding S4 domain protein  32.26 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  36 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5459  RNA-binding S4 domain protein  30.91 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507195  normal  0.0728213 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.18 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  32.81 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  32.81 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  36.11 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  38.1 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  29.73 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  35.09 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  46 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  36 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  37.25 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  36.73 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  29.41 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  36.51 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  39.13 
 
 
120 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.13 
 
 
120 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.13 
 
 
120 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  36.73 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  36.73 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2738  RNA-binding S4 domain protein  30.91 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000217923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  36.73 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  36.73 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  36.73 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  36.73 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  36.73 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  34.38 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  36.07 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2398  RNA-binding S4 domain protein  34.69 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  38.78 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  38.78 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1589  RNA-binding S4  28.57 
 
 
136 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292038  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  30.3 
 
 
131 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.73 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.78 
 
 
135 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.73 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>