84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0965 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.15 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  48.28 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  53.23 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.84 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  50.82 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  54.1 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.75 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.23 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  55 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  45.24 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  54.84 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  50 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  57.41 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  54.84 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  51.61 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.23 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  42.5 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  51.67 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  50 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.82 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  50.82 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.68 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  43.37 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.82 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  41.57 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  48.33 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  48.72 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  51.67 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  46.67 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.57 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.33 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  47.54 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  40.74 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  43.9 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  43.55 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  39.13 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  36 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  38.33 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  42.42 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  36 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  32.91 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  42.62 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  39.22 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.07 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  37.1 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  38.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  44.68 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  46.94 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1827  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.25 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000868037  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  37.29 
 
 		 120 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  48 
 
 		 133 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.29 
 
 		 120 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.29 
 
 		 120 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  41.18 
 
 		 82 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  41.56 
 
 		 82 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.7 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00885  heat shock protein 15  44.9 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.467007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.38 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2578  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  32.89 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.33 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  37.7 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  35 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  33.33 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 		 127 aa  40  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>