143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2068 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 81 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.91 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  55.56 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  39.51 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.6 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  51.67 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  42.68 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  42.17 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  40.74 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  46.91 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  45.31 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  53.23 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  43.21 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  43.21 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  42.5 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.11 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  42.68 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.96 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.33 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  44.78 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  38.75 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  44.44 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.8 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.31 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.31 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  42.11 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  42.11 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  47.56 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  39.51 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.74 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  41.98 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  38.96 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.27 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  43.33 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  37.8 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2293  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.53 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0107303  normal  0.537391 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  35.53 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  39.34 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  43.55 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.02 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  35.53 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  35.53 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  44.12 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  42.25 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.68 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  35.44 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  43.55 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  39.39 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  38.1 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.1 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.51 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.51 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  35.37 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.51 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.51 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  37.18 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.51 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  36.51 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  40.32 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  38.1 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  43.4 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  36.25 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  36.51 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  36.51 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  33.77 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  40 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  42 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  44.23 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.59 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  32.05 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.23 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  36 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.51 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2663  RNA-binding S4  38.75 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1827  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.8 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000868037  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2708  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.75 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0322974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2693  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.75 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  46.15 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  34.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  33.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  34.57 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  39.39 
 
 		 314 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>