More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2596 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2596  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2452  hypothetical protein  89.18 
 
 		 194 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0956  chorismate mutase  39.15 
 
 		 291 aa  114  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  33.15 
 
 		 272 aa  92.8  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.7 
 
 		 284 aa  91.7  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 293 aa  90.9  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  35.75 
 
 		 380 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  31.89 
 
 		 286 aa  85.9  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.11 
 
 		 385 aa  84.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  33.15 
 
 		 356 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  34.78 
 
 		 280 aa  84.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.11 
 
 		 385 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.11 
 
 		 385 aa  84.7  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  29.35 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  29.73 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  32.26 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 311 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  32.63 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  28.5 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  32.77 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  30.93 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  30.68 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  29.57 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  30.93 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  30.93 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  31.87 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  29.53 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  29.32 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.84 
 
 		 386 aa  77.8  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  29.55 
 
 		 280 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.04 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  27.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.32 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.47 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  31.25 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  27.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.37 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  29.78 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  31.72 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  29.55 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  24.47 
 
 		 662 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.84 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  29.55 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  30.81 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.26 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  24.34 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  28.89 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  32.02 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.38 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  28.98 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.4 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.38 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  30.98 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  26.94 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  22.87 
 
 		 662 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  31.41 
 
 		 413 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.38 
 
 		 357 aa  71.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  32.02 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  32.43 
 
 		 418 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  33.15 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  28.15 
 
 		 386 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  32.4 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  29.35 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  29.71 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.79 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0517  prephenate dehydratase  28.96 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.72305  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  22.34 
 
 		 659 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  27.87 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  28.49 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  23.83 
 
 		 664 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  28.02 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.32 
 
 		 671 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  23.4 
 
 		 664 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  24.35 
 
 		 662 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1142  prephenate dehydratase  31.46 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  28.65 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  28.98 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.61 
 
 		 391 aa  67.8  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  33.89 
 
 		 274 aa  67.8  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  31.07 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  26.7 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  27.55 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  29.83 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.81 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  22.87 
 
 		 664 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  27.55 
 
 		 552 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  29.87 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  30.34 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  21.81 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>