More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2452 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2452  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  403  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2596  hypothetical protein  89.18 
 
 		 194 aa  367  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0956  chorismate mutase  41.27 
 
 		 291 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 293 aa  96.3  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 272 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  34.05 
 
 		 286 aa  95.5  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.16 
 
 		 284 aa  94.4  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.05 
 
 		 385 aa  90.9  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.05 
 
 		 385 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.05 
 
 		 385 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 285 aa  89.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  32.58 
 
 		 356 aa  88.6  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  34.05 
 
 		 280 aa  88.2  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  29.73 
 
 		 288 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  35.2 
 
 		 380 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  29.02 
 
 		 391 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.26 
 
 		 386 aa  86.3  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  30.81 
 
 		 277 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  29.35 
 
 		 283 aa  86.3  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  30.81 
 
 		 277 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  30.81 
 
 		 277 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  31.61 
 
 		 304 aa  85.1  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.07 
 
 		 311 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.72 
 
 		 385 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  30.43 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  32.77 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.57 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  32.97 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.72 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.42 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  30.41 
 
 		 403 aa  82.4  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  31.91 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  28.98 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  28.42 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.87 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.98 
 
 		 373 aa  78.6  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  28.98 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  28.98 
 
 		 276 aa  78.2  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  27.53 
 
 		 385 aa  77.8  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  29.44 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.84 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  28.33 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  28.8 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  29.38 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  33.11 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  28.98 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  24.47 
 
 		 662 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  32.07 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  30.37 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  27.57 
 
 		 371 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  29.55 
 
 		 283 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  29.89 
 
 		 286 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.03 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  28.65 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  23.94 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  28.96 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0517  prephenate dehydratase  29.51 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.72305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.57 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  30.68 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  28.57 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  28.57 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  30.34 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.8 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  27.27 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  27.03 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  33.89 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0776  prephenate dehydratase  31.46 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.351833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.37 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0047  prephenate dehydratase  30.34 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  26.56 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  26.56 
 
 		 367 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.37 
 
 		 357 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  29.05 
 
 		 279 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  26.56 
 
 		 364 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  27.32 
 
 		 399 aa  72  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28.42 
 
 		 358 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  26.56 
 
 		 364 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  28.41 
 
 		 364 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  30.89 
 
 		 413 aa  71.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  31.28 
 
 		 277 aa  71.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  30.53 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  26.04 
 
 		 364 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.42 
 
 		 386 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.151676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  26.42 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2811  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.42 
 
 		 386 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2861  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.42 
 
 		 386 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0154655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.42 
 
 		 386 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.34961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  27.84 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  24.21 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>