197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2538 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2538  hydrogenase expression/formation protein HypC  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2393  hydrogenase expression/formation protein HypC  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3289  hydrogenase assembly chaperone HypC  50.72 
 
 
81 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2887  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50.72 
 
 
81 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.348602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  55.07 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2016  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.58 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.95 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.83 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  47.83 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50.75 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  45.07 
 
 
81 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3760  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  46.38 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  52.31 
 
 
83 aa  72  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2742  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.45 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4098  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  57.41 
 
 
72 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1071  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61575  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.38 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0118  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  45.83 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00072564  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1538  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  58 
 
 
62 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241221  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2135  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2181  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2122  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.717614  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1946  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0307  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  45.45 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1644  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.1 
 
 
80 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0088  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.33 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1176  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.76 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10029  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2009  hydrogenase expression/formation  45.76 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345013  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0973  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.58 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82669  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00530  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  42.03 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379393  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.93 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1091  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3797  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.13 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.777616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.33 
 
 
74 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.73 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1499  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.91 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.707569  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2406  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  42.03 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  35.53 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1211  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.62 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0975666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.78 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2140  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.930293  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.99 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.5 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.11 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.29 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3822  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.57 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564526  normal  0.0529395 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  38.57 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.11 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0138  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.78 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0491338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.31 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3231  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1097  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.47 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3879  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1892  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.99 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.71 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1400  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.39 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.303909  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7253  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.93 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.401886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0307  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  35.62 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.29 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08050  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.36 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0366  hypothetical protein  36.62 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3402  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.78 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1243  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.800937  normal  0.165339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.78 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.51 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.44 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0723  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.58 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0558163  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1090  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.73 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1600  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2026  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.82 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  36.49 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4558  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.36 
 
 
71 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.76 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2360  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.23 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.694078  normal  0.0901368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1024  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.169012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.82 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3876  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 
81 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3903  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.08 
 
 
78 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0984  hydrogenase assembly chaperone  31.58 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.322582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2978  hydrogenase assembly chaperone  31.58 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2865  hydrogenase assembly chaperone  31.58 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>