188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0984 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02578  HypC  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.775434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2853  hydrogenase assembly chaperone  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.516809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3980  hydrogenase assembly chaperone  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0984  hydrogenase assembly chaperone  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.322582 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02543  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2865  hydrogenase assembly chaperone  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3016  hydrogenase assembly chaperone  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3149  hydrogenase assembly chaperone  98.89 
 
 
90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2978  hydrogenase assembly chaperone  96.67 
 
 
90 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3045  hydrogenase assembly chaperone  96.67 
 
 
90 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.694918  hitchhiker  0.00501296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3009  hydrogenase assembly chaperone  96.67 
 
 
90 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00899127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3061  hydrogenase assembly chaperone  96.67 
 
 
90 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.045323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3166  hydrogenase assembly chaperone  96.67 
 
 
90 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.438087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3201  hydrogenase assembly chaperone  80 
 
 
90 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  57.78 
 
 
91 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2526  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  55.84 
 
 
96 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.234436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2437  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.06 
 
 
97 aa  86.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3170  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02866  hydrogenase 2 accessory protein  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4302  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.322153  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1287  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.14 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.917168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3417  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02815  hypothetical protein  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0703  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3276  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3458  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3325  hydrogenase 2 accessory protein HypG  55.56 
 
 
82 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.834406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3396  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887296  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3491  hydrogenase 2 accessory protein HypG  56.79 
 
 
82 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3316  hydrogenase 2 accessory protein HypG  55.56 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000211231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3390  hydrogenase 2 accessory protein HypG  55.56 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.50292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1418  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  53.25 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.3 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.181199  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2486  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.75 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2185  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.16 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  44.83 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2159  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.56 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0703588  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0508  hydrogenase expression/formation protein HypC  38.71 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0536  hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC  42.86 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.08 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3363  hypothetical protein  39.56 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.18 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3235  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0713  hydrogenase assembly chaperone HypC  41.98 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4558  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.23 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0861  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.98 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.339436  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3822  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40.91 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564526  normal  0.0529395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.77 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.976554  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3876  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.84 
 
 
81 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0794  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.25 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.481869  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08050  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.96 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1381  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  36.84 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00885593  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.96 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1664  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.473831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.93 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3208  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.3 
 
 
98 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3402  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.59 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  35.9 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.19 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1097  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.47 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4589  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.96 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00530  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  33.73 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379393  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0517  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.56 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.735802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.71 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.03 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.27 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0326  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.44 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0307  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  41.77 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0475  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.56 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0503  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.56 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.56 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.14 
 
 
78 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1272  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.74 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.444775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  34.67 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.67 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.36 
 
 
79 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.71 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.43 
 
 
71 aa  52  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.44 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  34.62 
 
 
83 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2538  hydrogenase expression/formation protein HypC  31.58 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2393  hydrogenase expression/formation protein HypC  31.58 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  40 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2490  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.03 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.228537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.43 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  31.08 
 
 
71 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.18 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  32.43 
 
 
71 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2331  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.25 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.89 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.84 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0138  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.05 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0491338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>