183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1961 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
85 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  74.65 
 
 
81 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  72.46 
 
 
75 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  59.77 
 
 
87 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  64.47 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  59.15 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2887  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  61.43 
 
 
81 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.348602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3289  hydrogenase assembly chaperone HypC  61.43 
 
 
81 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  54.79 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2742  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  53.66 
 
 
82 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  57.97 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3760  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.52 
 
 
75 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4098  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  63.79 
 
 
72 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2538  hydrogenase expression/formation protein HypC  47.95 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2393  hydrogenase expression/formation protein HypC  47.95 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1538  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  59.02 
 
 
62 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241221  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1176  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.24 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10029  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2016  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48 
 
 
75 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2009  hydrogenase expression/formation  49.3 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345013  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1091  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.33 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1097  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.21 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.5 
 
 
85 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.21 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1499  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.707569  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08050  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  48.1 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4589  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.53 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.57 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7253  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  53.45 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.401886 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.33 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.36 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3235  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.98 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.17 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.04 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0475  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0503  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1071  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.78 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61575  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.89 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2406  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.44 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  40.28 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0307  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  46.97 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214881  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0872  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.644778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.38 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0366  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3876  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.03 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.73 
 
 
83 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.47 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.36 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2135  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.1 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2181  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.1 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2122  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.1 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.717614  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.43 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.89 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1758  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.66 
 
 
82 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  38.55 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.16 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1090  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.18 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.99 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0138  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.38 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0491338  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1946  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.66 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.1 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2026  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.62 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1343  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0263  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0088  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0517  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.735802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  35.9 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3208  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.02 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0794  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.74 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.481869  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.59 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40.26 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.62 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0727  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.99 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.267852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0653  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.99 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0575  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.306359  normal  0.178324 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1045  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.99 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1644  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1892  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.89 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1287  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.96 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.917168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1882  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.21 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.99 
 
 
90 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1907  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.21 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0933507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1664  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.18 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.473831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1914  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.21 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.384554  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1024  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.169012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.96 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3903  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.79 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.68 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  33.33 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0536  hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC  37.5 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>