200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0463 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
74 aa  146  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.3 
 
 
71 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  50 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  45.07 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  46.48 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.58 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03900  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.83 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00530  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.84 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379393  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.21 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1097  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.28 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.14 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0475  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.44 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.44 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0503  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.44 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.48 
 
 
76 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0517  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.38 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.735802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  47.22 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.83 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  45.83 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.06 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0872  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.29 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.644778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1091  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.25 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.71 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3015  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.06 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.83 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  47.14 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0727  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.44 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.267852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3879  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.45 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0138  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.12 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0491338  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0653  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.44 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1045  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.44 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1739  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2538  hydrogenase expression/formation protein HypC  42.67 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2393  hydrogenase expression/formation protein HypC  42.67 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.84 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.06 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2331  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.79 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1892  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.44 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0118  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  49.28 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00072564  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.38 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3635  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.76 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.43 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  40.28 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.79 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.79 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0366  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  60.5  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1914  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.25 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.384554  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  36.84 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.18 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.1 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1090  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1600  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.54 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  41.67 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1272  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.43 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.444775  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0088  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.66 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1882  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.85 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3231  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.99 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1907  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.85 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0933507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1024  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.169012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.44 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0177  hydrogenase expression/formation protein  42.86 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1664  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.84 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.473831  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.47 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.99 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2026  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.44 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2406  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
102 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2412  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.85 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0703435  hitchhiker  0.0000250564 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1411  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.93 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0248831  normal  0.151516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2742  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.18 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1815  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.44 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1211  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.54 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0975666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02578  HypC  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0984  hydrogenase assembly chaperone  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.322582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2853  hydrogenase assembly chaperone  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.516809 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.775434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2092  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.03 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1499  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.18 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.707569  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02543  hypothetical protein  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3980  hydrogenase assembly chaperone  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1870  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.03 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.85 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.56 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3201  hydrogenase assembly chaperone  37.66 
 
 
90 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2865  hydrogenase assembly chaperone  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3016  hydrogenase assembly chaperone  36.49 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.03 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0723  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.89 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0558163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.16 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0575  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.306359  normal  0.178324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.99 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.31 
 
 
71 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>