98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2360 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2360  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.694078  normal  0.0901368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1071  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  69.44 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  64.79 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0973  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  65.22 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3797  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  63.77 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.777616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  62.5 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2406  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  59.72 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2122  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.52 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.717614  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2181  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.52 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2135  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.52 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1946  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  59.15 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3231  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.94 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  53.12 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3402  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  60.34 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0723  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.31 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0558163  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1642  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.31 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.72 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1784  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.88 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.62 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1763  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.19 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0531  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  47.62 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.78 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.78 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.25 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  50.94 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.85 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1538  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40.68 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241221  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4098  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1176  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10029  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2393  hydrogenase expression/formation protein HypC  44.23 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.44 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.44 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2538  hydrogenase expression/formation protein HypC  44.23 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.54 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  43.64 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.23 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1090  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.71 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2742  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.53 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.98 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  40 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3760  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.1 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.26 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.181199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2016  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3879  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.24 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1400  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.94 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.303909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.92 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.96 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0575  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.29 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.306359  normal  0.178324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1211  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.6 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0975666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.07 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0536  hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC  34.29 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.86 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1343  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.86 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0263  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.86 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1091  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.81 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2887  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.51 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.348602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3289  hydrogenase assembly chaperone HypC  41.51 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2009  hydrogenase expression/formation  34.43 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.43 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3876  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.75 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0138  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0491338  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.85 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0118  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  54.17 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00072564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3208  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.74 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.36 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.31 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.67 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3903  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.18 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0307  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.74 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  37.74 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  35.38 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  33.96 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  27.94 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3635  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.51 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1243  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.55 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.800937  normal  0.165339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.1 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0088  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.48 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.91 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0307  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  35.29 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.48 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0794  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.43 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.481869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.68 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.39 
 
 		 86 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  29.23 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00530  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  33.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2140  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.930293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.88 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.98 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.29 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  33.33 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1411  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.29 
 
 		 74 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0248831  normal  0.151516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.51 
 
 		 91 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1024  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.98 
 
 		 74 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.169012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>