190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3402 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3402  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
80 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  67.07 
 
 
83 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  57.5 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3797  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  54.79 
 
 
89 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.777616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0973  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  53.42 
 
 
89 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82669  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1071  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  56.25 
 
 
93 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61575  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2135  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.5 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2181  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.5 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2122  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.5 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.717614  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  60.27 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2406  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.95 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1763  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  52.05 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3231  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  53.52 
 
 
94 aa  84.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.15 
 
 
83 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0723  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.22 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0558163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.15 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1642  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.22 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  48.61 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0508  hydrogenase expression/formation protein HypC  53.66 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.1 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.37 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2159  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  53.66 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0703588  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1784  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.83 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1946  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50.68 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3903  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.44 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0531  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  44 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2360  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  60.34 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.694078  normal  0.0901368 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3363  hypothetical protein  51.22 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.56 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.976554  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.76 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1400  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50.68 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.303909  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.22 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3879  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.33 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  43.02 
 
 
86 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0536  hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC  44.58 
 
 
100 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  47.3 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.57 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0794  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.68 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.481869  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
71 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.27 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.3 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3235  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.46 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3876  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1418  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.72 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  36.11 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1211  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.54 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0975666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2526  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.57 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.234436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00530  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  41.67 
 
 
77 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379393  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.67 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.181199  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.45 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  36.11 
 
 
71 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4558  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.96 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3208  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.59 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1287  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.65 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.917168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  43.48 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3170  hydrogenase 2 accessory protein HypG  42.86 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3396  hydrogenase 2 accessory protein HypG  43.42 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887296  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3390  hydrogenase 2 accessory protein HypG  42.11 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.50292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3316  hydrogenase 2 accessory protein HypG  42.11 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000211231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.26 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3325  hydrogenase 2 accessory protein HypG  42.11 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.834406  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3491  hydrogenase 2 accessory protein HypG  43.42 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2185  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.75 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2009  hydrogenase expression/formation  47.27 
 
 
70 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.345013  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2486  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.02 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02578  HypC  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.775434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0984  hydrogenase assembly chaperone  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.322582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3822  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  39.76 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564526  normal  0.0529395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02543  hypothetical protein  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2853  hydrogenase assembly chaperone  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.516809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3980  hydrogenase assembly chaperone  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2865  hydrogenase assembly chaperone  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3016  hydrogenase assembly chaperone  43.59 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02866  hydrogenase 2 accessory protein  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0703  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3276  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4302  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.322153  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2887  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.26 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.348602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02815  hypothetical protein  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3458  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3289  hydrogenase assembly chaperone HypC  40.26 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3417  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.56 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  41.1 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.8 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03900  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.88 
 
 
71 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3760  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.54 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.56 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.21 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.89 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3149  hydrogenase assembly chaperone  43.59 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.03 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3061  hydrogenase assembly chaperone  38.82 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.045323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2978  hydrogenase assembly chaperone  38.82 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>