201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1215 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1215  hydrogenase maturation factor  100 
 
 
71 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1433  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  95.77 
 
 
71 aa  140  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1241  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  92.96 
 
 
71 aa  137  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.83 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0463  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.07 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03900  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.59 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  50.72 
 
 
83 aa  72  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00530  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  47.83 
 
 
77 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379393  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2950  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.22 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1946  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.48 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.123557  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1095  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  45.71 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.44829  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.701167  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  43.06 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.07 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3231  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0723  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0558163  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.44 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0088  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.57 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0118  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  48.05 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00072564  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.03 
 
 
71 aa  63.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.79 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3879  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.24 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
76 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2135  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402409  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1763  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2181  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2122  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.717614  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.68 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.65 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  36.11 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1400  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.1 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.303909  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2406  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.33 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3402  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.11 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3903  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.89 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.33 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1642  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3635  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1090  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2257  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.49 
 
 
83 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1784  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.11 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 
105 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0764  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.07 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0531  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  34.67 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  40.28 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.16 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1411  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.03 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0248831  normal  0.151516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2538  hydrogenase expression/formation protein HypC  42.03 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2393  hydrogenase expression/formation protein HypC  42.03 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.44 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1892  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  42.86 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.54 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2308  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.14 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.685831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3797  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.777616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  41.67 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3064  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.13 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0268  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0307  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  39.39 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0973  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82669  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  38.89 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1071  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61575  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3015  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.18 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.71 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1499  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.24 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.707569  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2016  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.23 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1243  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.800937  normal  0.165339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0366  hypothetical protein  39.13 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0138  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.29 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0491338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1024  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.78 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.169012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  35.21 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0872  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  41.43 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.644778  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0307  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1870  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.99 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2026  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.21 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1091  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.66 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1600  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.23 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1815  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.58 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.39 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.68 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3289  hydrogenase assembly chaperone HypC  37.68 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2092  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.58 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  32.47 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.17 
 
 
93 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  40.3 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.62 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.78 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3491  hydrogenase 2 accessory protein HypG  32.89 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2887  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.68 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.348602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1287  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.14 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.917168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>