190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2036 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2036  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1848  base excision repair protein, HhH-GPD family  48.31 
 
 		 322 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1527  HhH-GPD family protein  48.31 
 
 		 322 aa  93.6  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0472301  normal  0.34415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  33.04 
 
 		 309 aa  70.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 489 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.71 
 
 		 287 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  29.36 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  26.17 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  27.1 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3366  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.36 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1215  DNA-3-methyladenine glycosylase II  28.7 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2545  alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  26.17 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.73 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  26.17 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  26.17 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  27.1 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.17 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42700  DNA-3-methyladenine glycosidase II  28.44 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  26.17 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1486  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.86 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.253605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1888  alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753852  normal  0.559526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3585  DNA-3-methyladenine glycosidase II  28.44 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1213  HhH-GPD  32.11 
 
 		 297 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.235749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3657  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.93 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00421015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0844  HhH-GPD  28.41 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2635  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.61 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1646  base-excision DNA repair protein  30.39 
 
 		 232 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  26.17 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5315  transcriptional regulator Ada  33.94 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1593  base-excision DNA repair protein  30.39 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  31.19 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.02 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 523 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04456  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.28 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1271  HhH-GPD family protein  30.39 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0855  HhH-GPD family protein  34.38 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.908552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1385  HhH-GPD family protein  24.79 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0499849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2727  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  24.79 
 
 		 209 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0884865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1116  HhH-GPD  31.43 
 
 		 205 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3255  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.79 
 
 		 224 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00136627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2569  DNA-3-methyladenine glycosylase protein  25.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0601  HhH-GPD family protein  28.44 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1689  DNA-glycosylase family protein  24.56 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053666  normal  0.0261669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2841  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.58 
 
 		 216 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0702  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.67 
 
 		 251 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0291  HhH-GPD family protein  23.85 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000526477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 513 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2435  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.41 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2335  HhH-GPD family protein  27.52 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.695781  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1673  DNA repair protein  30.68 
 
 		 202 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4002  DNA-3-methyladenine glycosidase II  27.72 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0684  DNA-3-methyladenine glycosidase  28.44 
 
 		 226 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2156  DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.21 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3183  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0107  HhH-GPD  25.42 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2525  HhH-GPD family protein  25.74 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0924  HhH-GPD  24.37 
 
 		 243 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.03 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.22 
 
 		 220 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1072  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 527 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2163  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 328 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5238  HhH-GPD family protein  25.21 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2913  alcohol dehydrogenase  26.13 
 
 		 308 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.304572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0630  DNA-3-methyladenine glycosylase II  22.94 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000706264  normal  0.223656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4886  HhH-GPD  24.37 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2799  transcriptional regulator, Ada family/DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.77 
 
 		 496 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2423  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 496 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.55 
 
 		 303 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2076  HhH-GPD family protein  26.5 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.180031  normal  0.218221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28630  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  27.78 
 
 		 324 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387023  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2427  HhH-GPD family protein  27.62 
 
 		 368 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.610261  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.43 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.43 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.43 
 
 		 303 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.43 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3025  HhH-GPD  27 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.559258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 492 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.43 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.23 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0925  HhH-GPD family protein  28.05 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0738  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.23 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  19.44 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0813  HhH-GPD  23.53 
 
 		 240 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0242454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0790  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.13 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.36 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2436  3-methyladenine DNA glycosylase II  28.57 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  19.44 
 
 		 312 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3554  HhH-GPD family protein  24.75 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  0.658408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3139  AlkA domain protein  28.57 
 
 		 308 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1157  HhH-GPD  24.56 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.018776 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  19.44 
 
 		 312 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  19.44 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.27 
 
 		 303 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  19.44 
 
 		 312 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  19.44 
 
 		 312 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  19.44 
 
 		 312 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  26.36 
 
 		 303 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1026  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.23 
 
 		 220 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>