195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4899 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4899  permease-like protein  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  72.84 
 
 		 351 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  62.79 
 
 		 355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  70.67 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  59.72 
 
 		 394 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  72.37 
 
 		 352 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  72.37 
 
 		 372 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  58.11 
 
 		 360 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  59.46 
 
 		 354 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  54.44 
 
 		 387 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  55.68 
 
 		 354 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  61.11 
 
 		 352 aa  95.9  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  59.46 
 
 		 354 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  64.71 
 
 		 356 aa  95.1  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  59.46 
 
 		 354 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  62.5 
 
 		 361 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  57.65 
 
 		 352 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  57.65 
 
 		 352 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  63.38 
 
 		 365 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  58.33 
 
 		 353 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  59.72 
 
 		 358 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  56.32 
 
 		 381 aa  92.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  54.12 
 
 		 346 aa  92.4  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  56.32 
 
 		 352 aa  92.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  58.33 
 
 		 371 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  56.94 
 
 		 365 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  56.94 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  59.46 
 
 		 371 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  52.33 
 
 		 354 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  60.87 
 
 		 384 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  56.94 
 
 		 359 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  54.43 
 
 		 363 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  54.76 
 
 		 350 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  51.69 
 
 		 358 aa  89  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  49.45 
 
 		 398 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  56.52 
 
 		 354 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  58.57 
 
 		 352 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  58.57 
 
 		 352 aa  88.6  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  49.45 
 
 		 353 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  58.57 
 
 		 352 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  58.57 
 
 		 352 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  58.57 
 
 		 352 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  58.57 
 
 		 352 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  58.57 
 
 		 352 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  50.55 
 
 		 353 aa  88.2  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  49.45 
 
 		 350 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  58.57 
 
 		 374 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  60.29 
 
 		 352 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  57.14 
 
 		 355 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  57.14 
 
 		 355 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  55.07 
 
 		 353 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  56.34 
 
 		 353 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  52.44 
 
 		 373 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  56.94 
 
 		 389 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  56.94 
 
 		 406 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  47.25 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  53.03 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  41.86 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  40.23 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  61.11 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  41.86 
 
 		 363 aa  72  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  54.84 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  41.82 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  35.44 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  34.21 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  35.23 
 
 		 362 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  33.85 
 
 		 379 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  33.85 
 
 		 409 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  33.85 
 
 		 379 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  39.68 
 
 		 359 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  36.99 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  39.68 
 
 		 359 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  42.11 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  41.33 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  38.98 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  34.67 
 
 		 353 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  38.98 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  42.11 
 
 		 361 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  42.03 
 
 		 354 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  35.63 
 
 		 361 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  43.48 
 
 		 349 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  42.65 
 
 		 349 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  40.58 
 
 		 346 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  34.21 
 
 		 346 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  49.15 
 
 		 352 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  34.62 
 
 		 370 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  41.18 
 
 		 348 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  34.83 
 
 		 364 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  38.98 
 
 		 375 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  36.51 
 
 		 359 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  40.28 
 
 		 395 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  28.77 
 
 		 354 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  42.62 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  32.18 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  32.89 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  40.28 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  40 
 
 		 419 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  32.89 
 
 		 400 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>