72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1459 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  100 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  60.39 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  61.04 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  57.79 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  57.79 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  60.13 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  57.79 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  55.56 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  55.56 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  53.9 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  56.86 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  54.9 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  54.25 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  56.21 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  54.9 
 
 		 149 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  53.59 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  53.59 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  59.48 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  54 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  51.3 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  51.33 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  53.59 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  52.6 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  50 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  45.1 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  48.34 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  48.37 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.3 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  47.71 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  46.41 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  43.23 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  41.29 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  42.58 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  43.05 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  40.4 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  43.05 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  40.13 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  39.35 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  47.71 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  33.33 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.03 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  34.62 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  29.27 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  28.46 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.09 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  25.6 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.6 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.46 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  26.4 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.76 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.53 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.68 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.56 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.08 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.87 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  25.33 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.87 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.87 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.87 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  31.25 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.77 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2594  DNA polymerase III chi subunit HolC  32 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  30.23 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  43.9 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.13 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  29.17 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  32.26 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>