60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2599 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 149 aa  307  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  91.95 
 
 		 149 aa  283  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  91.95 
 
 		 149 aa  283  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  69.86 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  56.38 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  59.06 
 
 		 149 aa  189  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  59.73 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  57.72 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  57.33 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  54.9 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  56.95 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  55.33 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  56 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  55.33 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  53.69 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  54 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  51.68 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  51.68 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  48.99 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  47.65 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  46.26 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  50 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  45.95 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  48.99 
 
 		 151 aa  146  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  47.06 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  47.65 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  45.64 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  48.32 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  41.72 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  41.61 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  41.06 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  41.72 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  38.93 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  40.4 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  41.5 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  40.82 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  36.42 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  33.56 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.11 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  42.28 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.89 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.6 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.06 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  26.87 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.43 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  35.37 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  32.94 
 
 		 547 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  24.62 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  26.24 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  31.78 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.69 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  36.27 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 551 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 551 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 551 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 551 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 547 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 545 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 545 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.29 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>