59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3053 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  63.51 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.3 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  46.41 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  46.98 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.67 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.67 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  42 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.67 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.33 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.33 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  42 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  46.26 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  39.6 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  36.91 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  40.94 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  38.93 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  38.93 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  40.27 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  39.6 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  40.94 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  38.93 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  42.76 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  39.6 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  38.78 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  36.6 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  37.67 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  39.6 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  38.26 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  38.93 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  40 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  36.11 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  39.33 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  38.26 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  39.74 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  41.38 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  40.67 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  40 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  37.24 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  38.3 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  30.82 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.47 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  29.41 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  28.57 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  30 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  29.17 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  31.73 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.24 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  30.77 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  27.01 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>