65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1755 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  69.86 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  67.81 
 
 		 149 aa  214  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  67.81 
 
 		 149 aa  214  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  60.96 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  60.27 
 
 		 149 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  60.27 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  59.86 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  59.86 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  54.79 
 
 		 149 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  59.18 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  59.86 
 
 		 150 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  59.18 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  56.46 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  53.42 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  57.14 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  57.82 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  55.1 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  55.1 
 
 		 150 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  55.03 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  52.35 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  51.02 
 
 		 149 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  54 
 
 		 153 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  56.76 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  50 
 
 		 151 aa  151  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  51.02 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  44.52 
 
 		 150 aa  141  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.81 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  44.06 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  42.28 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  42 
 
 		 154 aa  111  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  40.4 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  40.52 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  39.33 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  38.93 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  40.54 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  37.67 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  32.19 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  36.49 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  45.52 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.57 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  28.47 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.62 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.17 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  42.47 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  27.69 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.17 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.03 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  31.03 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  32.95 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  32.95 
 
 		 142 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  28.93 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.71 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  24.32 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  23.19 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  24.32 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  25.83 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.57 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  30.53 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>