45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0509 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 149 aa  317  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  56.38 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  55.7 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  55.7 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  51.02 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  45.64 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  45.64 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  44.97 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  46.98 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.1 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  46 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  47.33 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  47.33 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.33 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  47.33 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  40.94 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.05 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  46 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.51 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  40.82 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  42.95 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  41.61 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  40.27 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  40.94 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  40 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  40.27 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  37.41 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  42 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  36.91 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  36.11 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  34.44 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  32.45 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  34.44 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  34.01 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  33.11 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  35.37 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  36.24 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  27.15 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  24.66 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  22.38 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.08 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  25.35 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.27 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  22.9 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>