94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3108 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  100 
 
 		 150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  84 
 
 		 150 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  82.67 
 
 		 150 aa  261  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  82.67 
 
 		 150 aa  261  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  80 
 
 		 150 aa  261  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  81.33 
 
 		 150 aa  258  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  57.05 
 
 		 150 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  55.03 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  55.03 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  58 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  53.9 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  56 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  51.68 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  56 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  52 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  57.82 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  56 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  54.36 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  53.33 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  54 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  50.34 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  50.67 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  50.67 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  49.35 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  48.68 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  50.34 
 
 		 153 aa  151  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  46 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  44.67 
 
 		 160 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  41.22 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  44.37 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  42.67 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  41.06 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  39.74 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  39.04 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  39.74 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  40.82 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  38.41 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  37.5 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  44 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  27.89 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  31.97 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  30.22 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  31.67 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  30.33 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.41 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.53 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.15 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.47 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  23.91 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  28.15 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2224  DNA polymerase III subunit chi  32.23 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.43 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.57 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.97 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.81 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1224  DNA polymerase III chi subunit  28.99 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.009619  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.76 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  30.83 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  36.78 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  36.78 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  36.78 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  30.83 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  26.43 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  27.54 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.76 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2678  DNA polymerase III subunit chi  41.82 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.09 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.79 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  27.34 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.76 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.71 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.71 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  27.34 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  25.44 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  29.41 
 
 		 141 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.71 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  27.54 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.39 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  31.45 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.69 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.87 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  27.66 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>