66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1228 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  59.86 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  50.34 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  48.98 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  48.98 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  46.62 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  47.92 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  46.62 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  46.26 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  48.34 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  44.9 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  45.83 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  44.52 
 
 		 172 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  44.44 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.95 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.95 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.27 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.27 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  43.75 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  42.76 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  41.5 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.59 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.71 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.95 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.22 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  43.06 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  43.06 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  42.67 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  37.41 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  43.33 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  42.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  43.84 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  41.33 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  44.52 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  38.67 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  38.78 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  38.78 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  34.03 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.57 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  44.52 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  27.27 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.9 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.85 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  32.04 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  33.03 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  29.32 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  27.27 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.52 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.36 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  30.93 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.36 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.09 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  30.93 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  29.9 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.51 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.13 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0739  DNA polymerase III, chi subunit  31.65 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.35 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  27.27 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.35 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  28.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  28.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  28.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  30.23 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>