90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2411 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 155 aa  304  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  63.51 
 
 		 148 aa  167  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  51.32 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  52.08 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  46.31 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  49.02 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.33 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.33 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.33 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  44 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.67 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.67 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.67 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  44.3 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  42.95 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  42.95 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  45.52 
 
 		 172 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  45.21 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  42.28 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  44.52 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  42.95 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  47.37 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  40.94 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  36.24 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  42.28 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  43.62 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  45.7 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  46.21 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  41.61 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  44.37 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  42.28 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  40.4 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  45.89 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  40.97 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  38.36 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  36.67 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  41.61 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  44.08 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  37.67 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  32.86 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.51 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  34.17 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  34.17 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  30.56 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  32.62 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  32.62 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  31.91 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  32.14 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  32.14 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  32.14 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2224  DNA polymerase III subunit chi  31.93 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  35.04 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  35.71 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  27.34 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  34.07 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.71 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  27.21 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.55 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.95 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  29.29 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.2 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  30.37 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.41 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2414  DNA polymerase III subunit chi  28.87 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  26.89 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  30.34 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  30.34 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  30.34 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  30.34 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  30.34 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01577  DNA polymerase III chi subunit  24.64 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.167803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  28.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  28.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  24.63 
 
 		 143 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>