128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2465 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  94.93 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  97.08 
 
 		 138 aa  248  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  95.62 
 
 		 138 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  95.62 
 
 		 138 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  82.61 
 
 		 138 aa  240  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  82.61 
 
 		 138 aa  239  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  89.86 
 
 		 138 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  90.58 
 
 		 138 aa  235  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  89.86 
 
 		 138 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  89.86 
 
 		 138 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  89.13 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  89.13 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  89.13 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  89.13 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2224  DNA polymerase III subunit chi  84.06 
 
 		 138 aa  216  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  69.4 
 
 		 144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  65.69 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2409  DNA polymerase III subunit chi  50.74 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446453  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  47.79 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2414  DNA polymerase III subunit chi  58.57 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2218  DNA polymerase III subunit chi  58.57 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2678  DNA polymerase III subunit chi  58.57 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  52.94 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  46.76 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  45.39 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  46.71 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  48.61 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  47.76 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  41.48 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  41.01 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3540  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.53 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2731  DNA polymerase III subunit chi  44.93 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  39.29 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  42.22 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.25 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1726  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.3 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1922  DNA polymerase III chi subunit, HolC  39.55 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  41.61 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2594  DNA polymerase III chi subunit HolC  40 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  37.86 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  37.86 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.48 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  41.89 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  37.14 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  35.71 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  35.71 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  37.86 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.85 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  35 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  36.43 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  39.71 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  39.69 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  38.4 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  35.71 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  34.29 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  32.85 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  32.85 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.61 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.45 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  36.84 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  33.8 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  33.8 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.05 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.77 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.33 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0052  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.09 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.13 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.13 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.46 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.06 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  29.13 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.09 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.09 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.09 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.09 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.75 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  33.8 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.75 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  29.5 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.7 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.83 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.82 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  30.25 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0394  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.1 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  30 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0042  DNA polymerase III, chi subunit  29.41 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1264  DNA polymerase III subunit chi  27.27 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000426106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  30.99 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.23 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  27.87 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0791  DNA polymerase III, chi subunit  30.7 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  36.11 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.15 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  33.91 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  26.28 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>