107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0052 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0052  DNA polymerase III chi subunit, HolC  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0050  putative DNA polymerase III, chi subunit  39.16 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.443992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0042  DNA polymerase III, chi subunit  38.32 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  31.01 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  29.32 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.63 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.57 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  32.14 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.97 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  31.43 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  27.5 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.93 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.47 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.48 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.85 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  28.26 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  29.71 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  29.77 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3721  DNA polymerase III subunit chi  28.19 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.88 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0387  DNA polymerase III subunit chi  27.52 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.88 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.88 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  27.94 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  27.61 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  27.61 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.66 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0443  DNA polymerase III subunit chi  27.78 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  27.03 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.41 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1922  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.87 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.51 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  26.32 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1726  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.17 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0791  DNA polymerase III, chi subunit  26.02 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.4 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  26.4 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  32.43 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0561  DNA polymerase III subunit chi  30.17 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.4 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  31.53 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.93 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  26.87 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0739  DNA polymerase III, chi subunit  23.12 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2594  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.25 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  22.3 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2084  DNA polymerase III subunit chi  24.82 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000200147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  26.4 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.79 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  25.93 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.72 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.47 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  29.91 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.19 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.19 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  29.91 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.19 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  29.91 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  28.03 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3540  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.94 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2224  DNA polymerase III subunit chi  33.1 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3544  DNA polymerase III subunit chi  26.98 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0256768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4046  DNA polymerase III subunit chi  26.98 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3680  DNA polymerase III subunit chi  26.98 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03636  DNA polymerase III subunit chi  27.27 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.45 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  29.25 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  27.22 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  26.12 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  26.12 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  27.48 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  26.12 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  27.48 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1378  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.41 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  30.63 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  26.72 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  25.48 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  29.91 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002427  DNA polymerase III chi subunit  26.26 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0267935  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  30.77 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  27.21 
 
 		 142 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 160 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>