46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0042 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0042  DNA polymerase III, chi subunit  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0050  putative DNA polymerase III, chi subunit  84.21 
 
 		 151 aa  266  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.443992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0052  DNA polymerase III chi subunit, HolC  38.32 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  29.41 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.83 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  28.67 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  28.66 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  25.17 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  27.21 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.86 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.32 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  26.67 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  27.81 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  27.21 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.33 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  27.1 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  26.28 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.68 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  25.64 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.19 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.53 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  25.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.08 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  23.68 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  25.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  25.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.31 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  26.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  27.45 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  27.45 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.83 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3721  DNA polymerase III subunit chi  24.67 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  25.34 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  25.58 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  32.94 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  32.94 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  32.94 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  25 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  25 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  25.64 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  23.81 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.49 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  22.37 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.46 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>