122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2682 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  81.12 
 
 		 144 aa  225  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  68.66 
 
 		 138 aa  192  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  64.18 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  63.43 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  69.4 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  69.4 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  69.4 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  68.66 
 
 		 138 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  67.91 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  67.91 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  66.42 
 
 		 138 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  65.67 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  65.67 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  65.67 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  65.67 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  65.67 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  65.67 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  65.67 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2414  DNA polymerase III subunit chi  61.7 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2678  DNA polymerase III subunit chi  63.12 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2224  DNA polymerase III subunit chi  62.69 
 
 		 138 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2218  DNA polymerase III subunit chi  62.41 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2409  DNA polymerase III subunit chi  49.65 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446453  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  52.74 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  46.76 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  46.38 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  43.79 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  45.26 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3540  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.71 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  43.66 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.48 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  43.88 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  41.73 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  39.57 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1726  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.73 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.92 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1922  DNA polymerase III chi subunit, HolC  41.73 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2731  DNA polymerase III subunit chi  42.36 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2594  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.06 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  38.85 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  40.28 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.2 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  40.28 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  41.13 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  38.03 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  40.41 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  41.26 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  41.26 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  40.43 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  38.89 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  38.19 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  41.38 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  39.71 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  38 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.99 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  40.44 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  36.11 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  36.11 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  36.81 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.68 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  34.03 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  34.68 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  36.36 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  30.94 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  30.94 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  35.29 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  35.83 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.08 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  32.79 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.41 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.08 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.8 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.68 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.79 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1264  DNA polymerase III subunit chi  29.75 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000426106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.79 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.79 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.79 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.89 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.08 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.74 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0052  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.18 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0042  DNA polymerase III, chi subunit  25 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.95 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  31.03 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  28.67 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0394  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.57 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.81 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.94 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  24.81 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.09 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.03 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1378  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.71 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  28.57 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  30.77 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  31.62 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  28.68 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0050  putative DNA polymerase III, chi subunit  23.7 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.443992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.33 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>