125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2224 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2224  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 138 aa  283  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  85.51 
 
 		 138 aa  255  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  84.78 
 
 		 138 aa  254  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  81.88 
 
 		 138 aa  237  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  84.06 
 
 		 138 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  84.06 
 
 		 138 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  84.06 
 
 		 138 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2382  DNA polymerase III subunit chi  83.33 
 
 		 138 aa  213  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2514  DNA polymerase III subunit chi  82.61 
 
 		 138 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  82.61 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  80.43 
 
 		 138 aa  207  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  80.43 
 
 		 138 aa  206  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  80.43 
 
 		 138 aa  206  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  80.43 
 
 		 138 aa  206  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  79.71 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  79.71 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  79.71 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  79.71 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  62.69 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  59.85 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2414  DNA polymerase III subunit chi  61.43 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2678  DNA polymerase III subunit chi  60.71 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  45.59 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2218  DNA polymerase III subunit chi  60 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  48.2 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  50.74 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2409  DNA polymerase III subunit chi  46.32 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446453  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  42.11 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  42.22 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.11 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  43.97 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  44.2 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2731  DNA polymerase III subunit chi  46.38 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  41.48 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3540  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.88 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  43.28 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.26 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.29 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  36.43 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  36.43 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  36.43 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1726  DNA polymerase III chi subunit HolC  36.57 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  36.43 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  40.44 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1922  DNA polymerase III chi subunit, HolC  35.82 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2594  DNA polymerase III chi subunit HolC  36.43 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  37.4 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  37.04 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  37.16 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  35.04 
 
 		 144 aa  84.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  35 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.12 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  34.29 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  34.31 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  37.4 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  34.31 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  31.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  31.43 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  30.71 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  33.94 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  31.91 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  31.91 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.58 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.68 
 
 		 176 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  36.36 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0052  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.58 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.78 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.61 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0902  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.79 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3263  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.25 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1256  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.25 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00560451  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1131  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.69 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000927432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1202  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.35 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1132  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.35 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3111  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.25 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00130972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3120  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.75 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000377435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.23 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1060  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.93 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  27.66 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3423  DNA polymerase III, chi subunit  30.47 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.1 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0791  DNA polymerase III, chi subunit  32.26 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  26.45 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.19 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.51 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.44 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  28.37 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.72 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1264  DNA polymerase III subunit chi  26.05 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000426106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0394  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.73 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0042  DNA polymerase III, chi subunit  28.76 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  25.21 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.33 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.33 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.66 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>