62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0892 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  51.7 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  36.81 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  36.99 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  41.51 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  38.19 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  36.3 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  33.57 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  34.97 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  37.93 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.67 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  37.04 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  31.51 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  35.86 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  33.1 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.72 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  31.03 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.03 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  28.89 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  30.34 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  33.03 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  32.41 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.86 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.86 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  28.57 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  29.63 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  29.63 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  31.72 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.17 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.86 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  32.65 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  30.2 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  29.86 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.47 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  28.67 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  22.38 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  30.34 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0042  DNA polymerase III, chi subunit  31.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  28.97 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  29.45 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  37.74 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  30.34 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0050  putative DNA polymerase III, chi subunit  30 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.443992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.68 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.78 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  33.33 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  34.38 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  37.88 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  37.88 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  37.88 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  37.88 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  37.88 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3738  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  36.36 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>