64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1816 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 154 aa  311  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  61.18 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  58.28 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  56.95 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  58.22 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  55.33 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  57.05 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  46.36 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  46.36 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  43.71 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.37 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  42 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.05 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  41.72 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.14 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.06 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.48 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  42.48 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  41.72 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.42 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.52 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  39.74 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  38.67 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  39.74 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  39.74 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  38.16 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  34.44 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.13 
 
 		 153 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  39.74 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  35.33 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  36 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  36 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  34.87 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  39.33 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  34.67 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  34.67 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.97 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  44.37 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  31.76 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  31.58 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  29.93 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  30.22 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01577  DNA polymerase III chi subunit  25.53 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.167803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  28.47 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  28.37 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.66 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  27.66 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.66 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  30.28 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  31.19 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3738  DNA-directed DNA polymerase  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  31.48 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  31.19 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  31.48 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  31.48 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  30.28 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  31.78 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>