76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1675 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  84.56 
 
 		 151 aa  269  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  75.17 
 
 		 150 aa  231  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  67.11 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  67.79 
 
 		 150 aa  217  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  67.11 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  63.76 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  54 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  55.33 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  54 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  53.33 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  53.33 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  56.46 
 
 		 172 aa  169  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  52 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  56.67 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  56.67 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  54 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  51.33 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  49.66 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  52.6 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  47.65 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  47.33 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  47.33 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  42.76 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  45.58 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.91 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  40 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  41.61 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  38 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  36.67 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  38.93 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  35.33 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  36.55 
 
 		 157 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  36.42 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  35.33 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  34.93 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  34.93 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  42.28 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.35 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  32.61 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.01 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.83 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  30.36 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  30.3 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0960  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.2 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  35.04 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.43 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.97 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  34.44 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  31.54 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  32.56 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  32.5 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1224  DNA polymerase III chi subunit  27.89 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.009619  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.26 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1016  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.253766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2338  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0673  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.813274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2948  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1177  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0824  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1023  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1652  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.36 
 
 		 146 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2470  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1854  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.93 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  34.44 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2465  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  32.58 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.39 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0394  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.14 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5796  DNA polymerase III subunit chi  34.09 
 
 		 138 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>