59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1224 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1224  DNA polymerase III chi subunit  100 
 
 		 152 aa  311  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.009619  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  30.15 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0739  DNA polymerase III, chi subunit  28.32 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0394  DNA polymerase III chi subunit, HolC  34.62 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  33.01 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0561  DNA polymerase III subunit chi  31.3 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  27.34 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  28.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2557  hypothetical protein  25.21 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3738  DNA-directed DNA polymerase  28.18 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.9 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4046  DNA polymerase III subunit chi  29.29 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3680  DNA polymerase III subunit chi  29.29 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3544  DNA polymerase III subunit chi  29.29 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0256768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2685  hypothetical protein  38.64 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2409  DNA polymerase III subunit chi  28.78 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446453  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  35.06 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.99 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.57 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  28.18 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  25 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  27.13 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.26 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.26 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3721  DNA polymerase III subunit chi  27.42 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  28.26 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.48 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  27.89 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  28.81 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  27.13 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.88 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  27.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  26.52 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1858  DNA polymerase III chi subunit HolC  32.53 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  29.41 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2203  DNA polymerase III, chi subunit  32.53 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  25.24 
 
 		 141 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  24.29 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0443  DNA polymerase III subunit chi  26.61 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.21 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.17 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  24.44 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0387  DNA polymerase III subunit chi  26.61 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.12 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  24.43 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>