42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0649 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  100 
 
 		 156 aa  322  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  59.74 
 
 		 151 aa  197  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  53.25 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  52.6 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  52.6 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  49.35 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  50.65 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  50.65 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  48.05 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  47.06 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  47.06 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  47.06 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  47.06 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  46.75 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  46.41 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.3 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  45.1 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  43.51 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  44.81 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  43.42 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  45.45 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  44.81 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  43.51 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  42.95 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  44.44 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  43.51 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  42.76 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  40.91 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  42.38 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  40 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  40.52 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  39.61 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  36.6 
 
 		 148 aa  94.4  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  36.84 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  36.67 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  36.67 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  37.33 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.11 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  36.67 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  25.66 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30.2 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  28.17 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>