160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4230 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  84.03 
 
 
292 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  84.03 
 
 
292 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  81.94 
 
 
291 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  81.6 
 
 
293 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  80.9 
 
 
300 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  80.41 
 
 
292 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  83.39 
 
 
290 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  78.8 
 
 
318 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  72.54 
 
 
303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  73.87 
 
 
310 aa  441  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  68.53 
 
 
289 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  68.88 
 
 
289 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  66.09 
 
 
289 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  68.53 
 
 
289 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  68.88 
 
 
289 aa  400  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  66.09 
 
 
296 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  69.93 
 
 
289 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  68.18 
 
 
289 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  69.93 
 
 
289 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  68.18 
 
 
289 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  68.18 
 
 
289 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  69.93 
 
 
289 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  69.93 
 
 
289 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  69.93 
 
 
289 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  69.93 
 
 
289 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  69.93 
 
 
289 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  65.38 
 
 
289 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  65.49 
 
 
298 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  65.14 
 
 
294 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  61.72 
 
 
285 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  63.38 
 
 
294 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  63.73 
 
 
294 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  63.89 
 
 
291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  64.44 
 
 
303 aa  354  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  59.11 
 
 
299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  58.8 
 
 
291 aa  334  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  57.24 
 
 
323 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  56.89 
 
 
323 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  56.89 
 
 
323 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  61.09 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  56.54 
 
 
325 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  56.99 
 
 
290 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  58.43 
 
 
294 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  53.85 
 
 
291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  56.49 
 
 
288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  51.4 
 
 
299 aa  292  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  53.52 
 
 
284 aa  289  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  47.95 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  48.11 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  50.35 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  51.04 
 
 
297 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  50 
 
 
295 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  55.09 
 
 
280 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  50 
 
 
299 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  51.04 
 
 
297 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  48.29 
 
 
296 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  50.87 
 
 
296 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  49.14 
 
 
296 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  48.12 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  47.6 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  47.95 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  47.26 
 
 
295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  50.35 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  46.58 
 
 
295 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  46.39 
 
 
295 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  46.39 
 
 
348 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  48.77 
 
 
292 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  47.54 
 
 
289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  46.85 
 
 
295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  46.39 
 
 
297 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  45.8 
 
 
294 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  50.39 
 
 
259 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  44.41 
 
 
294 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  50.71 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  50.71 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  45.61 
 
 
296 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  44.06 
 
 
297 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1719  hypothetical protein  46.79 
 
 
324 aa  236  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  44.21 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1807  hypothetical protein  48.41 
 
 
296 aa  233  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  normal  0.98572 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1540  hypothetical protein  45.36 
 
 
328 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  43.71 
 
 
296 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  43.01 
 
 
297 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1039  protein of unknown function DUF815  50.21 
 
 
296 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  44.52 
 
 
296 aa  228  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  42.56 
 
 
297 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  46.12 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  47.74 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  47.74 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  46.53 
 
 
325 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_004310  BR0889  hypothetical protein  41.32 
 
 
288 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  41.61 
 
 
292 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0885  hypothetical protein  41.32 
 
 
288 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  46.53 
 
 
306 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  43.53 
 
 
296 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  42.86 
 
 
287 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  45.49 
 
 
291 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  39.16 
 
 
307 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  42.66 
 
 
291 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>