161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3077 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  100 
 
 		 294 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  97.96 
 
 		 294 aa  593  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  92.83 
 
 		 294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  89 
 
 		 298 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  89 
 
 		 303 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  76.06 
 
 		 289 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  75.44 
 
 		 289 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  74.73 
 
 		 289 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  75 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  75 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  75 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  75.09 
 
 		 289 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  74.38 
 
 		 289 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  74.02 
 
 		 289 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  74.02 
 
 		 289 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  69.86 
 
 		 285 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  74.73 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  74.73 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  74.73 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  74.73 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  74.73 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  74.73 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  74.73 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  66.32 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  66.2 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  66.9 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  65.51 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  64.56 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  64.56 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  63.76 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  63.38 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  63.86 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  65.37 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  62.9 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  63.16 
 
 		 291 aa  341  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  62.98 
 
 		 296 aa  328  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  59.72 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  56.29 
 
 		 288 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  56.49 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  56.38 
 
 		 290 aa  301  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  57.09 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  53.9 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  53.29 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  53.29 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  56.54 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  52.96 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  54.9 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  50.34 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  50.17 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  50.34 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  49.83 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  50.67 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  49.66 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  50.17 
 
 		 348 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  49.65 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  49.31 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  49.33 
 
 		 296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  49.66 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  49.83 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  49.32 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  49.32 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  50.7 
 
 		 296 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  48.64 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  51.22 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  48.29 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  45.97 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  48.45 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  48.11 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  45.89 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  44.86 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  44.52 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  43.14 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  49.81 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  42.81 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  45.55 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1719  hypothetical protein  44.12 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  43.15 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  46.58 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1807  hypothetical protein  47.84 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  normal  0.98572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  47.92 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1540  hypothetical protein  42.48 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  52.47 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  52.47 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  43.86 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  45.91 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  45.17 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0639  hypothetical protein  47.04 
 
 		 253 aa  225  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486807  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1227  hypothetical protein  47.43 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  42.81 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  45.61 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  41.72 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  42.52 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  42.46 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1102  hypothetical protein  47.04 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.83556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  42.46 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  46.94 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  44.83 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  46.53 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  46.94 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>