162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1795 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  584  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  59.36 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  57.3 
 
 
289 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  57.41 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  56.94 
 
 
289 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  56.94 
 
 
289 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  56.74 
 
 
288 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  56.23 
 
 
289 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  57.35 
 
 
289 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  56.58 
 
 
289 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  55.87 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  55.87 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  57.41 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  57.41 
 
 
289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  58.8 
 
 
291 aa  301  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  56.58 
 
 
298 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  55.63 
 
 
294 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  55.99 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  55.99 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  55.99 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  53 
 
 
291 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  55.99 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  55.99 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  55.99 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  55.99 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  53.38 
 
 
292 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  53.52 
 
 
291 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  55.4 
 
 
285 aa  288  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  52.84 
 
 
292 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  52.84 
 
 
292 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  54.9 
 
 
294 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  54.26 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  54.9 
 
 
294 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  53.79 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  53.17 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  53.52 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  51.96 
 
 
291 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  50.89 
 
 
299 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  54.09 
 
 
296 aa  279  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  51.77 
 
 
291 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  49.82 
 
 
296 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  50.88 
 
 
296 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  56.23 
 
 
303 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  50.53 
 
 
300 aa  275  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  51.88 
 
 
303 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  50.36 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  49.65 
 
 
295 aa  272  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  51.06 
 
 
325 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  50 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  49.47 
 
 
299 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  49.65 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  50 
 
 
323 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  50 
 
 
323 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  47.69 
 
 
293 aa  268  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  50.18 
 
 
323 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  53.15 
 
 
294 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  50.18 
 
 
297 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  50.18 
 
 
297 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  48.76 
 
 
296 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  49.47 
 
 
295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  48.25 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  50.71 
 
 
280 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  52.28 
 
 
310 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  47.9 
 
 
296 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  48.04 
 
 
299 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  48.42 
 
 
295 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  49.82 
 
 
296 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  45.96 
 
 
294 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  45.61 
 
 
297 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  44.91 
 
 
296 aa  244  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  46.67 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  45.26 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  45.1 
 
 
294 aa  242  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  51.35 
 
 
287 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  51.35 
 
 
287 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  46.32 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  46.32 
 
 
288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  45.61 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  45.74 
 
 
292 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  45.59 
 
 
259 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  44.6 
 
 
297 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  47.96 
 
 
297 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  45.17 
 
 
298 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  46.32 
 
 
280 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  45.42 
 
 
291 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  45.49 
 
 
283 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  44.68 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  43.97 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  45.77 
 
 
296 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  43.25 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  44.09 
 
 
279 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  44.09 
 
 
279 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  42.46 
 
 
307 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  44.41 
 
 
295 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  43.71 
 
 
287 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1039  protein of unknown function DUF815  45.7 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  44.91 
 
 
291 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  42.66 
 
 
296 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>