161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2542 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2542  ATPase  100 
 
 
279 aa  567  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  567  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  95.29 
 
 
278 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  78.49 
 
 
291 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  75 
 
 
283 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  74.29 
 
 
280 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  70.76 
 
 
287 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  69.18 
 
 
304 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  67.5 
 
 
292 aa  381  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  66.55 
 
 
298 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  65.22 
 
 
320 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  64.46 
 
 
306 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  64.16 
 
 
292 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  68.48 
 
 
323 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  61.37 
 
 
287 aa  358  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  64.13 
 
 
296 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  63.6 
 
 
325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  64.39 
 
 
296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_004310  BR0889  hypothetical protein  62.72 
 
 
288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0885  hypothetical protein  62.72 
 
 
288 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  68.36 
 
 
324 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  64.75 
 
 
329 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  62.14 
 
 
307 aa  355  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  64.16 
 
 
296 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  64.73 
 
 
295 aa  349  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  63.27 
 
 
288 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  65.23 
 
 
291 aa  348  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  61.76 
 
 
291 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  66.93 
 
 
335 aa  344  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2852  protein of unknown function DUF815  61.65 
 
 
299 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0924763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0395  protein of unknown function DUF815  62.32 
 
 
290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.522501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  61.11 
 
 
290 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1766  hypothetical protein  59.5 
 
 
296 aa  329  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  60.37 
 
 
290 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1183  hypothetical protein  62.09 
 
 
289 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  47.25 
 
 
297 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  46.24 
 
 
296 aa  241  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  49.65 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  46.86 
 
 
296 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  45.69 
 
 
294 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  45.04 
 
 
291 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  47.48 
 
 
292 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  43.46 
 
 
294 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  43.43 
 
 
289 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  43.16 
 
 
294 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  44.67 
 
 
288 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  44.64 
 
 
297 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  44.93 
 
 
291 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  44.16 
 
 
289 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  44.16 
 
 
296 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  44.29 
 
 
297 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  44.29 
 
 
296 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  42.46 
 
 
294 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  43.06 
 
 
295 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  44.07 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  43.66 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  45 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  43.66 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  41.28 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  42.47 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  43.7 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  43.7 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  46.97 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  46.97 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  40.93 
 
 
299 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  44.96 
 
 
293 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  44.07 
 
 
289 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  44.07 
 
 
289 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  44.07 
 
 
289 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  44.09 
 
 
284 aa  218  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  42.75 
 
 
293 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  43.21 
 
 
295 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  42.96 
 
 
285 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  40.57 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  45.36 
 
 
297 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  41.09 
 
 
300 aa  215  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  43.26 
 
 
295 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  45.13 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  44.44 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  44.24 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  42.18 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  43.22 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  42.6 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  42.76 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  40.78 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  39.5 
 
 
297 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  44.62 
 
 
296 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  38.11 
 
 
299 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  42.86 
 
 
295 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  45.09 
 
 
280 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  41.54 
 
 
291 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  40.57 
 
 
296 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>