189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2113 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  58.87 
 
 
297 aa  329  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  57.5 
 
 
297 aa  324  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  57.45 
 
 
292 aa  322  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  48.75 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  46.27 
 
 
294 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  45.14 
 
 
292 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  48.4 
 
 
296 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  47.52 
 
 
296 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  47.33 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  44.76 
 
 
292 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  48.2 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  44.76 
 
 
292 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  47.16 
 
 
296 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  44.91 
 
 
300 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  46.86 
 
 
278 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  45.07 
 
 
291 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  44.91 
 
 
298 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  46.86 
 
 
279 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  46.86 
 
 
279 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  46.81 
 
 
348 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  46.81 
 
 
295 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  44.25 
 
 
325 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  45.39 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  46.45 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  46.98 
 
 
296 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  44.13 
 
 
296 aa  232  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  44.37 
 
 
329 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  44.04 
 
 
304 aa  232  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  43.06 
 
 
293 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  46.74 
 
 
296 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  43.71 
 
 
291 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  44.64 
 
 
310 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  43.97 
 
 
291 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  44.28 
 
 
287 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  47.2 
 
 
290 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  43.99 
 
 
303 aa  228  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  42.81 
 
 
287 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  42.81 
 
 
291 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  44.67 
 
 
299 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  48.02 
 
 
323 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_004310  BR0889  hypothetical protein  43.06 
 
 
288 aa  225  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  44.29 
 
 
280 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0885  hypothetical protein  43.06 
 
 
288 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0395  protein of unknown function DUF815  45.04 
 
 
290 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.522501 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  44.91 
 
 
296 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  46.32 
 
 
291 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2937  protein of unknown function DUF815  43.38 
 
 
485 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000616511  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  43.21 
 
 
335 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  44.21 
 
 
290 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  44.36 
 
 
296 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  47.62 
 
 
291 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  46.1 
 
 
323 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  46.1 
 
 
323 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  42.4 
 
 
300 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  44.4 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  42.61 
 
 
292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  42.96 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  48.39 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  42.14 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  44.1 
 
 
306 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  43.9 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  44.85 
 
 
320 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  44.04 
 
 
296 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  43.68 
 
 
292 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  42.45 
 
 
307 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  44.76 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1109  hypothetical protein  42.86 
 
 
435 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  41.13 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  41.49 
 
 
294 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  41.3 
 
 
299 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  39.12 
 
 
299 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  44.88 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  43.9 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  42.16 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  41.28 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  44.25 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  41.28 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  44.25 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2852  protein of unknown function DUF815  42.01 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0924763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  42.91 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  44.88 
 
 
430 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  44.88 
 
 
288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  42.91 
 
 
297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  43.66 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0284  hypothetical protein  42.75 
 
 
452 aa  212  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  42.2 
 
 
296 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  41.7 
 
 
290 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  43.4 
 
 
296 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  44.76 
 
 
295 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  40.28 
 
 
296 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2854  hypothetical protein  42.19 
 
 
447 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0399662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  43.55 
 
 
289 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1465  protein of unknown function DUF815  38.43 
 
 
273 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000978175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  43.9 
 
 
289 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  43.9 
 
 
289 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  43.94 
 
 
287 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  43.94 
 
 
287 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15640  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.63 
 
 
436 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  41.99 
 
 
295 aa  208  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>