160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1172 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  75.69 
 
 		 290 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  74.65 
 
 		 290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  77.06 
 
 		 288 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  71.33 
 
 		 287 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  67.59 
 
 		 292 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0889  hypothetical protein  68.9 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0885  hypothetical protein  68.9 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  65.94 
 
 		 304 aa  384  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  65.17 
 
 		 296 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  65.17 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  67.27 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  66.78 
 
 		 295 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  65.96 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  70.31 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  65.47 
 
 		 298 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  65.02 
 
 		 292 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  70.08 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  68.83 
 
 		 320 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  63.64 
 
 		 291 aa  361  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  68.15 
 
 		 324 aa  360  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  69.2 
 
 		 323 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  61.87 
 
 		 307 aa  358  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  68.13 
 
 		 335 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2852  protein of unknown function DUF815  60.78 
 
 		 299 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0924763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  62.28 
 
 		 283 aa  351  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1766  hypothetical protein  60.92 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  62.41 
 
 		 278 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  61.4 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  61.76 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  61.76 
 
 		 279 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1183  hypothetical protein  58.36 
 
 		 289 aa  342  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  60.44 
 
 		 280 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  60 
 
 		 287 aa  335  7e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0395  protein of unknown function DUF815  54.96 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.522501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  51.55 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  48.41 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  46.85 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  46.5 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  46.5 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  46.5 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  46.15 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  46.15 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  46.15 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  47.33 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  49.34 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  47.37 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  49.37 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  43.97 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  44.41 
 
 		 289 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  47.33 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  43.71 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  43.71 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  49.59 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  42.31 
 
 		 325 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  49.59 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  49.59 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  49.59 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  49.59 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  49.59 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  49.59 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  42.11 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  45.42 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  45.17 
 
 		 294 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  43.62 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  44.83 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  50.41 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  44.25 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  49.17 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  44.17 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  43.25 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  43.25 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  42.48 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  44.4 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  42.67 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  42.67 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  46.21 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  45.71 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  42.56 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  40.77 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  43.6 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  42.86 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  41.96 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0639  hypothetical protein  42.34 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  43.31 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  42.07 
 
 		 348 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  46.8 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  42.07 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  42.66 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  39.72 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  43.05 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  42.21 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1102  hypothetical protein  41.94 
 
 		 253 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.83556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3442  hypothetical protein  42.36 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21771  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1227  hypothetical protein  41.53 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  41.72 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  46.15 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  42.56 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  46.15 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  41.72 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>