164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1765 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  48.58 
 
 
297 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  47.26 
 
 
292 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  47.67 
 
 
297 aa  258  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  46.18 
 
 
307 aa  252  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  46.78 
 
 
325 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  48.04 
 
 
304 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  52.57 
 
 
296 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  46.85 
 
 
294 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  48.66 
 
 
320 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1799  hypothetical protein  44.79 
 
 
292 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0144353  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  48.51 
 
 
290 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2338  hypothetical protein  45.07 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  45.74 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0910  hypothetical protein  48.57 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151498  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2852  protein of unknown function DUF815  45.3 
 
 
299 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0924763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  48.73 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  48.73 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  47.54 
 
 
289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0889  hypothetical protein  45.24 
 
 
288 aa  242  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  46.24 
 
 
279 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  46.24 
 
 
279 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1980  hypothetical protein  45.88 
 
 
278 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.0452906 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0885  hypothetical protein  45.24 
 
 
288 aa  242  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  45.3 
 
 
299 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  47.57 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  48.09 
 
 
290 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  48.46 
 
 
324 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1212  hypothetical protein  44.83 
 
 
287 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  45.08 
 
 
294 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  46.18 
 
 
329 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  48.06 
 
 
323 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  47.84 
 
 
306 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  47.35 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  47.35 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  47.35 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  47.35 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  47.35 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  47.35 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  47.35 
 
 
289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1183  hypothetical protein  53.04 
 
 
289 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  45.55 
 
 
300 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  46.02 
 
 
296 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  47.67 
 
 
294 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  44.37 
 
 
292 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  50.65 
 
 
335 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  44.37 
 
 
292 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  44.82 
 
 
295 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  46.48 
 
 
289 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  49.34 
 
 
291 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  50 
 
 
291 aa  235  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  46.02 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  48.62 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  45.26 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  47.89 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2186  protein of unknown function DUF815  47.6 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  48.96 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  47.41 
 
 
259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0395  protein of unknown function DUF815  45.67 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.522501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  45.39 
 
 
296 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  48.82 
 
 
294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  45.68 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  47.52 
 
 
295 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  44.13 
 
 
296 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  46.9 
 
 
295 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  46.04 
 
 
295 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  45.21 
 
 
325 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  43.43 
 
 
299 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  43.84 
 
 
293 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  47.06 
 
 
291 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  49.39 
 
 
289 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  43.75 
 
 
296 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  46.88 
 
 
295 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  49.61 
 
 
310 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1766  hypothetical protein  44.26 
 
 
296 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  42.81 
 
 
288 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  45.23 
 
 
300 aa  228  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  44.52 
 
 
291 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  43.71 
 
 
296 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  46.88 
 
 
348 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  43.45 
 
 
291 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  43.71 
 
 
296 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  43.69 
 
 
292 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  45.91 
 
 
294 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  45.1 
 
 
289 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  45.91 
 
 
294 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  43.96 
 
 
323 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  43.96 
 
 
323 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  45.08 
 
 
303 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  44.19 
 
 
323 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2285  hypothetical protein  48.28 
 
 
291 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  45.16 
 
 
283 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  43.31 
 
 
297 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  46.51 
 
 
430 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  49.79 
 
 
290 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>