161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2662 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  91.7 
 
 
296 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  91.7 
 
 
289 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  87.89 
 
 
289 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  87.89 
 
 
289 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  87.89 
 
 
289 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  87.89 
 
 
289 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  87.2 
 
 
289 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  86.85 
 
 
289 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  86.85 
 
 
289 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  87.06 
 
 
289 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  87.06 
 
 
289 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  87.06 
 
 
289 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  87.06 
 
 
289 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  87.06 
 
 
289 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  87.06 
 
 
289 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  87.06 
 
 
289 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  74.74 
 
 
298 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  76.06 
 
 
294 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  76.06 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  75.7 
 
 
294 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3116  hypothetical protein  73.7 
 
 
303 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709574  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  65.74 
 
 
292 aa  400  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  66.2 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  65.74 
 
 
292 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  67.25 
 
 
292 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  66.09 
 
 
291 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  67.63 
 
 
285 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  65.38 
 
 
291 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  67.37 
 
 
290 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  65.85 
 
 
318 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  65.49 
 
 
300 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  64.83 
 
 
303 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  67.49 
 
 
291 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  62.12 
 
 
310 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  62.46 
 
 
299 aa  358  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  61.59 
 
 
291 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  64.37 
 
 
296 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  57.49 
 
 
291 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1546  hypothetical protein  56.94 
 
 
323 aa  331  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.597203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6283  hypothetical protein  56.94 
 
 
323 aa  331  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633753  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  58.13 
 
 
290 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6775  hypothetical protein  56.94 
 
 
323 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  57.14 
 
 
325 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  58.45 
 
 
294 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  56.14 
 
 
288 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  57.35 
 
 
284 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  51.39 
 
 
296 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  52.4 
 
 
299 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  51.4 
 
 
296 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  51.04 
 
 
296 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  53.15 
 
 
296 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  54.18 
 
 
300 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  51.22 
 
 
295 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  51.21 
 
 
296 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  51.57 
 
 
348 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  51.57 
 
 
295 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  51.57 
 
 
295 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  50.87 
 
 
296 aa  291  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  52.46 
 
 
295 aa  291  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  52.46 
 
 
299 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0028  ATPase  53.47 
 
 
280 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  49.65 
 
 
293 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  50.35 
 
 
296 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  51.23 
 
 
297 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  51.62 
 
 
299 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  50.88 
 
 
297 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  52.21 
 
 
289 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  48.24 
 
 
297 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  47.08 
 
 
295 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  45.67 
 
 
296 aa  255  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  45.52 
 
 
294 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  52.81 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  52.81 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  45.61 
 
 
294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  45.07 
 
 
297 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  47.37 
 
 
292 aa  248  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  48.59 
 
 
297 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  43.79 
 
 
297 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1719  hypothetical protein  45.73 
 
 
324 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.797394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  46.18 
 
 
298 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  49.61 
 
 
259 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1540  hypothetical protein  45.58 
 
 
328 aa  239  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1807  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  normal  0.98572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4749  protein of unknown function DUF815  43.75 
 
 
292 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  48.26 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4600  protein of unknown function DUF815  42.66 
 
 
296 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0977338  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4230  hypothetical protein  42.66 
 
 
296 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  48.26 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  46.71 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  46.83 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  48.57 
 
 
320 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  48.56 
 
 
324 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1172  hypothetical protein  44.41 
 
 
291 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818035  normal  0.230421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1794  hypothetical protein  44.37 
 
 
291 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587496  normal  0.0578948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1494  protein of unknown function DUF815  44.65 
 
 
290 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1692  protein of unknown function DUF815  44.28 
 
 
290 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  45.1 
 
 
296 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2661  hypothetical protein  43.21 
 
 
288 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0930864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  42.31 
 
 
307 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>